I Pokémon Snap er du den unge fotografen Todd, og du skal hjelpe Professor Oak å lage en rapport om hvilke Pokémon det er på en spesiell øy. Du skal ta bilde av Pokémon til rapporten.

Du er utstyrt med en spesiallaget safaribil kalt Zero-One, et kamera, epler, gasspokéballer og en Pokémonfløyte. Med disse hjelpemidlene skal du ta bilde av alle 63 Pokémon som innes på denne øya!


Men det er ikke bare å ta bilder av alle Pokémon, det må være GODE bilder. Pokémon må være nær kamera, de må se mot deg eller gjøre noe rart eller morsomt, de må være midt i bildet, og du får ekstrapoeng hvis det er andre Pokémon av samme sort med i bildet, eller hvis det er noe spesielt med de Pokémon. Du må velge selv et bilde av hver Pokémon og professor Oak må bedømme dem etterpå. Greier du å "ta bilde av alle nå"?